银行工程保函收费无全国统一固定标准，核心以保函金额为基数按比例收手续费，再叠加少量杂费，费率受保函金额、企业资质、项目风险等因素影响，不同类型保函收费也有差异，具体收费规则如下：

核心手续费

这是收费的主要部分，按保函金额的一定比例计算，整体年化费率区间在 0.5%-3%，且会随保函金额、期限等调整。不同金额对应的常见费率有明确区间，100 万元以下的保函年费率多为 2.5%-3%，收费通常 3000 元；100 - 500 万元区间年费率 2%-2.5%，收费 8000 元；500 万元以上年费率则降至 1.5%-2%，收费 15000 元。另外短期保函（1 年内）费率较低，2 年以上的长期保函费率可能明显上浮，像某银行 1 年期费率 1%，2 年期可能涨到 1.8%。

按保函类型的差异化收费

工程领域不同用途的保函，因风险不同费率有区别。投标保函风险，费率多在 0.1%-0.5%，工商银行这类保函收取 100 元 / 季；履约保函和预付款保函费率多为 0.5%-2%，单笔收费常为 300 元 / 季；农民工工资保函受政策影响，此前住建部新规要求必须银行开具后，其手续费普涨 0.2%，部分场景费用甚至可达合同造价的 5%。

额外费用

风险承担费：若项目风险高，如隧道、化工等复杂工程，或申请人资质较弱，部分银行会额外收取 0.1%-0.5% 的风险费。境外项目费率还会进一步上浮 20%-50%，EPC 项目比单一施工合同风险溢价高 0.5%。

其他杂费：开立时可能有一次性 500 - 2000 元的开立费；后续若需修改保函条款，金额修改每次收 500 - 2000 元，受益人变更每次 1000 - 3000 元；长期保函可能每年收取几千元的年审费，跨境保函还需额外计入 0.1%-0.15% 的信用证开证费和约 50 美元 / 次的 SWIFT 通讯费。

受特殊条件影响的费率调整

企业资质会显著影响费率，国企、上市公司等优质企业费率可低至 0.3%-0.8%；而中小企业或新客户费率可能达 1.5% 以上。若企业能提供保证金或抵押物，费率也会降低，比如存放 30% 的保证金可使年费率从 2.1% 降至 1.3%；反之纯信用担保的费率会处于较高水平。此外政府项目、绿色建筑等政策性扶持项目，还可享受对应的优惠费率。