预付款保函索赔期限延长需要缴纳费用。因为期限延长属于保函修改的范畴，会增加担保人的担保风险和责任周期，银行等担保人通常会按一定标准收取费用，具体收费规则因银行政策、保函金额等有所差异，以下是详细说明：

费用计收标准有明确依据：多数银行会按原预付款保函的费率，结合修改当日的保函余额以及延长的期限来计收费用。比如乐山市商业银行就规定，预付款保函作为非融资性保函，效期延长时，延长的期限按原保函费率和修改日保函余额计收，且担保期限不足一季的按一季收取。同时，部分银行还会额外收取保函修改的基础手续费，不过这部分费用和期限延长的核心费用是分开核算的。

费用核算的影响因素：费用金额主要受两个核心因素影响。一是保函余额，余额越高，按比例计收的费用自然越多；二是延长期限，延长时间越长，费用累计也会相应增加。此外，申请人的信用状况也可能间接影响，若申请人资信良好，或许能和银行协商到更优惠的费率；若资信一般，银行可能会维持基准费率甚至小幅上浮以覆盖风险。

费用缴纳的时间节点：通常在办理延期手续时需一次性缴清相关费用，银行在收到费用并完成审核后，才会正式出具保函延期通知书或签订保函修改协议，确保延期生效。若未按时缴纳费用，银行可能会驳回延期申请，导致原保函到期后自动失效。