1、知识产权费用企业要想成功拿下专精特新企业认定资格，是必须要掌握一定数量的知识产权的，而在这一过程中，往往会产生一定的费用，而且这个费用是一定需要支付的。对于专精特新企业认定中有Ⅰ类和Ⅱ类知识产权之分。其中，企业拥有的专利、植物新品种、国家新药、集成电路布图设计等属于Ⅰ类核心知识产权，是专精特新企业认定的首要和必须条件，在高企认定中也会给申请人带来相应较高的分数。此外，一些非核心知识产权：商标权、域名权、数据库特别权、商业秘密和科技成果等，对企业来说也是重要的知识产权。
2、人工与时间成本专精特新企业认定是一项非常复杂的工作，其有个特点就是耗时较长、准备周期长。因此专精特新企业认定费用中，必然会有相关的人工与时间成本，这一点是我们需要了解清楚的。
3、中介服务费用很多中小型公司并没有设置专项人员对接政府的相关项目，也就几乎没有人懂得申请专精特新企业，解决的方法无非是两种：
一是：招聘相关人员帮助企业对接。以目前市场情况来看，相关人员工资成本还是很高的，人员的经验却无法保证，申请的成功率更是难以保证。
二是：交给专业的代理机构。这样公司会更加方便，申请的成功率也变高，所花费的成本和招聘人员基本相同甚至更低。
4、审计费审计费有具有高企审计资质的会计事务所收取，价格根据地区和公司财务状况而定。
5、查新费查新报告有具有资质的第三方查新企业出具。具体价格视地区和企业状况而定。
6、产学研由企业和大专院校等机构签订的产学研合作协议，协议必须要有，且必须要实际发生，价格根据实际情况而定，产学研费用跨度很大，小的合作万元左右，大的合作百万都不止。申请省级专精特新的要求将会逐渐升高，审查机制也会越发严格。