航空运输方式主要有班机运输，包机运输、集中托运和航空快递业务。
1.班机运输
指在固定航线上飞行的航班。它具有固定开航时间、航线和停靠航站。班机运输通常为客货混合型飞机，货舱容量较小，难以满足大批量的货物运输，运价较高，但由于航期固定，有利于客户安排鲜活商品或急需商品的运送。
2.包机运输
当货物批量较大，班机方式不能满足运输要求时，一般就采用包机运输，分为整机包机和部分包机两种。
整机包机指航空公司或包机代理公司，按照与租机人双方事先约定的条件和费率，将整架飞机租给包机人，从一个或几个航空站装运货物至指定目的地的运输方式。它适合运送大宗货物，一般讲来其运费比班机运输运费低。我国民航的包机运费按每飞行一公里固定费率核收，对空放里程技每一飞行公里运价的70%收取空放费。
部分包机运输指由几家航空货运代理公司或发货联合包租一架飞机，或者由航空公司把一架飞机的舱位分别出租给几家航空货代公司。它适合于不足整机的货物，运费较班机低，但运送时间比班机长。
3.集中托运
指航空货运代理公司把若干批单独发运的货物组成一整批向航空公司托运，填写一份总运单，发运到同一站点，由航空货运代理公司委托当地的货运代理办理收货，报关，分拨等业务。集中托运的货物越多，支付的运费越低，因此在国际航空运输中使用较为普遍，集中托运是航空货运代理上的重要业务之一。
4.航空快递业务
由专门经营航空快递业务的公司与航空公司合作，向货主提供快速投递服务。具体做法为：公司派专人从发货处提取货物后，以快的方式将货物送往机场，装上近的航班，随即电告国外代理航班号，货名，收货人，以各接货。航班抵达目的港后，由专人接机提货，办妥进关手续后直接送达收货人。这种方式称为“桌至桌运输”，是一种为快捷的运输方式，特别适用于传送各种急需物品和文件资料。