医院是1912年由国家教育部创办的中国所国立高等医学院校——北京医学专门学校、 国立北平大学医学院附属医院发展而来，1937年在全民抗战的烽火中，为民族大义，为拯救和保存中国高等医学教育，迁陕重建，奠基并发展了西北地区的高等医学教育和现代临床医学，是西北所大学附属医院。

医院现开放病床2580张，年门急诊量240余万人次，年收住各类病人近14万人次。现有教职工4200余名，拥有576名副高级以上专业技术职称专家。50余名享受国家特殊津贴的专家教授及各类科技人才; 200余名专家分别担任全国和省市级医学专业学会的正副主任委员、常委等职务。

医院现有大型医疗装备3.0TMR核磁共振成像系统，全数字化平板探测器血管造影机（单板DSA），内窥镜手术控制系统，高端CT机、医用血管造影X射线机、PET-CT等大型医疗设备30余台；2021年新增客车型车载CT、移动P2实验室等移动医疗装备服务于临床医疗工作，极大提升了医院应对突发公共卫生事件的能力。

医院与省内外百余家基层医院建立托管、医联体和协作关系，充分发挥国家队的指导作用。被确定为国家区域医疗中心项目建设输出西安交通大学第二附属医院洛阳医院、西安交通大学第二附属医院新疆医院、西安交通大学第二附属医院杨凌示范区医院。医院坚持履行国家公立医院的社会责任，数十年如一日下乡巡回医疗、医疗扶贫、援助基层，对口支援西藏阿里地区、新疆等地区，进行医疗帮扶，多年承担苏丹、马拉维等非洲国家的医疗援助工作。在重大自然灾害、紧急抢险及疫情防控等公共卫生事件中充分发挥医疗应急救援职责、派出医护专家指导、救治在线，受到各级政府的高度肯定。