实验室结构和设施、操作规程、设备适用于对人体具有高度的危险性，通过气溶胶途径传播或传播途径不明，尚无有效的疫苗或方法的致病微生物及其毒素。与上述情况类似的不明微生物，也必须在四级生物防护实验室中进行。待有充分数据后再决定此种微生物或毒素应在四级还是在较低级别的实验室中处理。
实验脊椎动物生物防护实验室，其适用微生物范围与同级的一般生物防护实验室相同。
平面布局
a)三级生物防护实验室的核心区包括实验间及与之相连的缓冲间。
b)缓冲间形成进入实验间的通道。必须设两道连锁门，当其中一道门打开时，另一道门自动处于关闭状态。如使用电动连锁装置，断电时两道门均必须处于可打开状态。在缓冲间可进行二次更衣。
c)当实验室的通风系统不设自动控制装置时，缓冲间面积不宜过大，不宜超过实验间面积的八分之一。
d)Ⅱ级或Ⅲ级生物柜的安装位置应远离实验间入口，避开工作人员频繁走动的区域，且有利于形成气流由“清洁”区域流向“污染”区域的气流流型。
装置及特殊设备
a)必须在主实验室内设置Ⅱ级或Ⅲ级生物柜。其安装位置应满足6.3.2.5d)中的要求。
b)连续流离心机或其他可能产生气溶胶的设备应置于物理抑制设备之中，该装置应能将其可能产生的气溶胶经过滤器过滤后排出。在实验室内所必须设置的所有其他排风装置(通风橱、排气罩等)的排风均必须经过过滤器过滤后方可排出。其室内布置应有利于形成气流由“清洁”区域流向“污染”区域的气流流型。
c)实验室中必须设置不产生蒸汽的高压锅或其他装置。
d)实验间与外部应设置传递窗。传递窗双门不得同时打开，传递窗内应设物理装置。感染性材料必须放置在密闭容器中方可通过传递窗传递。
e）必须在实验室入口处的显著位置设置压力显示报警装置，显示实验间和缓冲间的负压状况。当负压指示偏离预设区间必须能通过声、光等手段向实验室内外的人员发出警报.可在该装置上增加送、排风过滤器气流阻力的显示。
f）实验室启动工作期间不能停电。应采用双路供电电源。如难以实现，则应安装停电时可自动切换的后备电源或不间断电源，对关键设备(生物柜、通风橱、排气罩以及照明等)供电。
g)可在缓冲间设洗手池：洗手池的供水截门必须为脚踏、肘动或自动开关。洗手池如设在主实验室，下水道必须与建筑物的下水管线分离，且有明显标志。下水必须经过处理。洗手池仅供洗手用，不得向内倾倒任何感染性材料。供水管必须安装防回流装置。不得在实验室内安设地漏。
病源微生物
引起人和动物致病的微生物叫病源微生物，有八大类：
1,：引起皮肤病。深部组织上感染。
2,放线菌：皮肤，伤口感染。
3,螺旋体：皮肤病，血液感染 如梅毒，钩端螺旋体病。
4,：皮肤病化脓，上呼吸道感染，泌尿道感染，食物中毒，败血压症，急性传染病等。
5,立克次体：斑疹伤寒等。
6,衣原体：沙眼，泌尿生殖道感染。
7,病毒：肝炎，乙型脑炎，麻疹，艾滋病等。
8,支原体：肺炎，尿路感染。
生物界的微生物达几万种，大多数对人类有益，只有一少部分能致病。有些微生物通常不致病，在特定环境下能引起感染称条件致病菌。 能引起食品变质，腐败，正因为它们分解自然界的物体，才能完成大自然的物质循环。