建有洁净用房的食品工厂厂区内的建筑物的位置应满足食品的生产工艺的需要，划分生活区，生产区中应明确区分洁净生产区，一般生产区和非食品处理区。
生产过程中发生空气污染较严重的建筑，应建在厂区内常年多风向的下风侧。
人员进出的管理。
凡进入净化车间的人员须进入(严禁从原材料和成品缓冲区进出)，首先进入换鞋区，换好净化鞋后，分别进入相应的衣帽间，脱下外衣，换上洁净工作服，然后进入风淋室，严格按照《风淋室使用规程》的规定，风淋后进入净化车间内。
进入净化车间的人员不得佩带与生产无关的饰品，如手机、MP3、MP4、收音机等电子产品不得带入车间；净化车间内与产品接触的工作人员须佩戴手套。
进入净化车间的物料、工具和新增设备须首先在拆包区内进行拆包处理，确保清洁，然后通过进料缓冲间进入，并做好相关记录的验收；
净化车间尽量不要存放与生产无关的物品，对存放的与生产无关的物品要注明存放日期，对存放时间超过两天的物品要定时清理，对不能存放在净化车间的物品和无用物品要及时清理。
车间设备的日常管理。
由设备工程师对车间内所有设备进行相应的准备记录工作，安排定时检查，并做好详细记录；
详细的操作说明和注意事项应贴在设备的醒目位置，严禁非人员操作设备；
对某些小故障，设备工程师应在一时间给予及时维修，如有大故障，应及时联系设备制造商提供售后服务。