微生物实验室自成一区，与其他实验室分开，门口设有门禁，只有相关人员刷卡后才能进入。微生物实验室面积310㎡，设有一间局部百级的检测室，一间检测室，一间致病菌检测室，一间洗刷室，一间霉菌培养室，一间培养室，一间微生物仪器鉴定室，一间培养基制备室，一间菌种保存室。
根据中华人民共和国卫生行业标准WS233-2002《微生物和生物医学实验室通用准则》以及国家标准GB19489-2004《实验室生物通用要求》，生物实验室分为一级、二级、三级、四级，习惯上称为P1、P2、P3、P4。二级生物实验室对人体、动植物或环境具有中等危害或具有潜在致病因子，对健康成人、动物和环境不会造成严重危害，具有有效的预防和措施。
无菌间使用要求：
1、无菌间通向外面的窗户应为双层玻璃，并要密封，不得随意打开，并设有与无菌间大小相应的缓冲间及推拉门，另设有0.5-0.7平方米的小窗，以备进入无菌间后传递物品。
2、无菌间内应保持清洁，工作后用2%-3%煤酚皂溶液，擦拭工作台面，不得存放与实验无关的物品。
3、无菌间使用前后应将门关紧，打开紫外灯，如采用室内悬吊紫外灯时，需30W紫外灯，距离在1.0m处，照射时间不少于30min，使用紫外灯，应注意不得直接在紫外线下操作，也可以用雾化过氧化氢设备，法国欧菲姆设备实用，便捷。
4、处理和接种食品标本时，进入无菌间操作，不得随意出入，如需要传递物品，可通过小窗传递。
5、在无菌间内如需要安装空调时，则应有过滤装置。
净化实验室应定期进行风速监测和及时更换过滤层罩，条件有限的实验室可使用超净工作台；无菌室应配紫外线装置，在使用前后都应用紫外线灯照射，并定期进行紫外线强度和空气质量监测。