1生物制药工厂工艺设计的具体对象是设计一个新的生物制药工厂，包括生产与辅助车间及设施，或对已有的工厂进行扩建、改建。一般包括总体设计与局部设计。凡是设计范围涉及整个工厂的，称总体设计。凡是设计的范围不涉及整个工厂的全部内容，而只是其中的某些部分或某一部分，称局部设计。
2生物制药工厂工艺设计的基本过程包括工艺包设计（基础设计）和工程设计两个阶段。工艺包设计通常是由专利商或具有工艺技术的工程公司的工艺专业主导来承担，提供工程公司作为工程设计的依据。工程设计通常又划分为工艺设计、基础工程设计和详细工程设计三部分。
3生物制药工厂洁净厂房污染控制包括尘粒控制和微生物控制，尤以微生物控制重要。
4尘粒控制和微生物控制又包括三个方面：①污染源控制；②散播过程控制；③交叉污染控制。
凡接触化妆品原料和半成品的设备,工具,管道必须用,无害,抗腐蚀材料制作,内壁应当光滑,便于清洁和。化妆品生产工艺流程应当做到上下衔接,人流物流分开,避免交叉。
生产过程的各项原始记录(包括工艺规程中各个关键因素的检查结果)应当妥为保存,保存期应当较该产品的保质期延长六个月。
使用的清洗剂,剂以及其他有害物品均应当有固定包装和明确标识,储存在专门库房或者柜厨内,由专人负责保管。
厂区内应当定期或者必要时进行除虫灭害工作,要采取有效措施防止鼠类,蚊,蝇,昆虫等的聚集和孳生。
生产区厕所设在车间外侧,必须为水冲式,有防臭,防蚊蝇及昆虫等措施。
净化工程应用范围较广的四大领域主要是指：电子工厂、制药厂、手术室、生物实验室，不同领域净化控制系统要求各不相同，同时这些领域控制标准可广泛应用于其他行业，如电子工厂净化工程的控制系统可用于PCB生产车间、电器、注塑车间等。四大领域净化工程的控制特点有以下不同：
电子工厂洁净度直接影响到电子产品的质量，采用一次送风、二次送风系统，大量使用FFU风机过滤机组层层净化空气，达到更衣室8级净化、走廊走道7级、生产车间6级，局部需要5级或4级之间，在工程完工后需要静态验收。
制药厂净化控制三个目标分别是洁净度，气闸室广泛使用六级标准，控制洁净室内无交叉污染；CFU是指洁净室内活菌个数;工程需要获得GMP认证;完成了这三个目标才能是一项合格的净化工程项目，工程系统需用值班风机局部5极，由药检局动态监控，静态验收后使用。
手术室控制较为严格，采用MAU+AHU系统，送风天花3m*3m,上千级净化级别，验收标准为静态验收，动态验收温度、湿度、CFU。通常情况下患者在做手术时感染率为25%，根据统计目前手术感染率达10%-15%，许多医院以日常手术感染率为考核手术室净化工程的优良指标。
生物实验室净化工程控制特点我国已制订相关条令，工程净化设备选用生物隔离服、独立供氧系统，废液、废气统一净化通过严密性试验后处理，采用密闭隔离器，负压二级屏障系统，保障人身，并制订好完善的生物实验室净化管理条令。
净化工程：控制产品 (如硅芯片等) 所接触大气的洁净度及温湿度，使产品能在一个良好的环境空间中生产、制造。此环境空间的设计施工过程即可称为净化工程。
净化工程是一个应用行业非常广泛的基础性配套产业，（21世纪）在电子信息、半导体、光电子、精密制造、医药卫生、生物工程、航天航空、汽车喷涂等众多行业均有应用，并根据行业的精密与无尘要求，等级差别也较大。
目前级别高的当属航天航空的航空仓，基本是属于1级，属于特殊领域，面积相对较小。