1、紫外线消毒灭菌：紫外线灯发出特定波长的紫外线，253.7nm的紫外线波长具有很强的杀菌作用，但是紫外线灯的杀菌能力随着使用时间的减退而减退，空气净化工程一般紫外灯的平均寿命在2000小时左右。空气净化工程公司
2、臭氧消毒法：臭氧是可以代替紫外灯消毒的一种无污染的消毒剂，消毒的时候，臭氧发生器放在送风或者是回风管道，利用空气为载体，消毒时间为1小时，全面消毒为2小时到2.5小时。
3、气体熏蒸消毒：空气净化工程在洁净室使得消毒液蒸发产生气体随空气扩散而消毒。消毒液的成分有：甲醛、环氧乙烷、过氧乙酸、石碳酸与乳酸的混合液，但是这中甲醛对人体有一定的伤害，消毒后需要进行空气置换。
4、消毒液消毒：空气净化工程用消毒液擦拭洁净室内的地面、门窗、墙壁以及设备。