运输过程中造成木箱包装破损的原因有三个方面：冲击、振动和压力。首先，汽车、火车等运输工具启动、变速、转向、刹车会使木箱包装的速度改变，运输工具因路面状况、路轨接缝、发动机振动、车辆防震性能、水面风浪、气流强度等因素，产生周期性上下颠簸和摇晃。若堆码松散，没有采取整体固定，木箱包装易与车厢或相邻木箱包装发生碰撞。其次，当运输工具的激励频率等于或很接近于产品的因有频率时，产品将发生共振现象，易造成木箱包装破损。
另外，堆码放置可提高运输工具空间利用率，但是堆码方式不同，木箱包装的稳定性差别显著，底层的木箱包装承受的压力大。同时，底层木箱包装还要承受车厢底板的动压力以及水平位移时产生的摩擦力，而动压力比静压力对木箱包装的危害更大。正是由于各种运输工具或运输方式都有不同的特点，因此在运输或转运之前必须了解木箱包装需要的起重车辆、卡板、集装箱或集装架等联合运输问题，确保木箱包装内易损元件的安全运输。