通常，用于灌肠的肠衣主要是猪肠，猪肠的扩张性更好。此外，绵羊肠衣有味道，有些人可能不喜欢它。猪肠衣较为常见，味道与公众一致。适合红色香肠之类，厚实。绵羊肠衣相对较薄，柔软而薄，适合香肠，体积小。
但是，不能说猪肠衣必须比羊肠衣更好，这需要具体看个人喜好。有些人觉得羊的味道，但有些人认为绵羊更具补性。此外，绵羊肠衣被广泛使用，除了香肠外，还可以制成用于生产网球拍，弓弦和手术缝合线的肠道。它在20世纪初开始在天津，北京等地建厂，加工生产，很快成为中国重要的出口材料。
从当今世界肠衣的实际使用来看，各种肠衣主要用于灌装各种香肠。猪，牛，羊肠衣具有口径均匀，肠壁厚度适中，长度一定的特点，是填充香肠最理想的材料。在许多国家，用猪肠衣制成的香肠称为法兰克福香肠。所有用羊肠制成的香肠都称为维也纳香肠。在美国，用羊肠制成的香肠被称为热狗。
此外，牛肠衣和羊肠衣也可用于各种球拍线羽毛球拍和网球拍。绵羊肠衣可用作琴弦，绵羊肠衣也可用作医用缝合线。此外，使用肠衣加工的甘氨酸钠也可用于制药工业。