农村污水由于地区分散，人口数量较大，收集难等原因造成农村污水成为水污染的主要组成因素，农村污水中含有大量的有机物和氮、磷等无机盐类。
根据农村污水的特点，其处理方法主要有以下几种：
1、高效藻类塘
高效藻类塘内存在菌藻共生体系，使塘内溶解氧浓度较高（保持好氧状态），二PH值则存在周期性变化；对COD的平均去除率可达70%，，氨氮主要通过消化作用去除，去除率>90%，硝酸盐主要通过沉淀作用去除，去除率为50%。
高效藻类塘与传统稳定塘相比，既有运行成本低、维护管理简单等优点，又克服了传统稳定塘停留时间过长、占地面积大等缺点，在处理农村及小城镇污水方面具有广阔的应用前景。目前已在太湖地区建立了高效藻类塘系统处理太湖地区农村生活污水的实验研究。
2、生物滤池
生物滤池是一个相对较新的水处理工艺，其的特点是集生物氧化和截留悬浮固体于一体，节省了后续沉淀池，厌氧水解——高负荷生物滤池处理系统集初沉淀、曝气池、污泥回流设施以及供氧设施等于一身，大大简化了污水处理流程。
3、人工湿地
人工湿地是利用人工水生态系统内多级生物的稀释降解作用来去除或削减水中生物的方法。人工湿地作为一种新型生态污水处理技术具有投资和运行费用低、抗冲击负荷能力强、处理效果稳定、出水水质好、水生植物有一定经济价值等诸多优点。用于农村生活污水处理的主要是潜流人工湿地。
4、无动力地埋式生活污水处理装置
生活污水首先进入厌氧消化池，污水中的悬浮物沉降下来成为污泥，污泥通过一定时间的自然发酵，有机物得到降解。